石室禅院是厦门经济特区杏林台商投资区(现为新阳工业区)最古老的寺院，它座落于霞阳的玳瑁山下，环境秀丽优雅，为海滨名胜之地。

    石室院原名石室仓，僧人晦庵始基之。据漳州府志、龙溪县志、海澄县志记载：“石室院建于后唐同光三年(公元925年)，明天顺八年(公元1464年)重修”。千余年来，沧桑变幻，屡经兴废，有史可稽者，元、明、清、民国五次进行重修，香火鼎盛之际，“殿构三重，拓僧舍六十有四，旁辟花园，中有亭八面，资产三十余石。”现存遗迹、遗物对此尚可印证。今仅大雄宝殿一栋，东西两侧僧房六间，是清光绪二十八年(公元1902年)重修后之物，已非当年旧观。五十年代初期，院中尚有僧尼主持管理，佛像钟鼓齐整，香火不断，游人不绝。以后遭受严重破坏，亭倒碑断，多数文物被毁。九十年代初，在厦门市、杏林区文物保护部门的重视下，定为区级文物加以保护。不少善男信女和香港、台湾同胞，马来西亚华侨自发出力捐资，进行清理维修。失散的文物，明、清、民国重修的碑记已搜集于院中；不久将辟为杏林台商投资区旖旎的旅游胜地和避暑山庄。

    石室禅院现为消灾延寿药师佛道场。寺院周围相传有十八景观，几经变迁，大多已消失，目前院后玳瑁山，奇石绚丽，多处发现古人之石刻；山腰现存景点：“高山飞瀑”气势磅礴，“仙人足迹”、“松圭争鸣”、“十八弯佛祖龛”栩栩如生，吸引了不少游客。明代戚继光抗倭遗迹——“游城古寨”、“尖山古寨”及山顶的“石旗”、“石鼓”尚保留基本完好，颇为壮观。院中古树参天，两棵白玉兰高数十丈，终年郁郁葱葱；西侧数棵古雅的黄金桂，四季开花，奇香扑鼻，相传种苗由南洋引进，树龄已上百年矣!寺院东侧为各朝代僧尼之墓穴，其中明代高僧正旭之母的寿城，规模庞大，目前仅存墓碑一方；长2．89米，宽0．84米，建于万历已酉季冬(公元1609年)，至今已近400年。院前明代辟为马寨，留下石马槽二件，亦有一定的历史参考价值。